Pedrosa yang sebelumnya tidak diprediksi tampil kompetitif langsung menyodok ke depan dan memimpin balapan sementara Stoner melorot ke posisi 4 dan Rossi di posisi kedua. Tak sampai 2 lap Stoner akhirnya bisa memimpin balapan dan Pedrosa sedikit demi sedikit melorot jauh ke belakang. Stoner tampaknya begitu dominan.
Tapi di lap ke 6 Stoner terjatuh ketika memimpin balapan. Otomatis Rossi yang berada di posisi kedua kini mempimpin balapan MotoGP Qatar. Diikuti oleh Doviozioso, Hayden, dan Lorezo di posisi ke 4. Stoner yang terjatuh harus rela keluar dan tidak bisa kembali balapan. Ini berarti Stoner gagal mencatat 4 kemenangan beruntun di MotoGP Qatar.
